ANNALES DE L’UNIVERSITE DE BANGUI
Série D, VOL 8, N°003/Décembre 2022 - 13
INTRODUCTION
La pandémie de Covid-19 a rappelé la nécessité de
renforcement des systèmes de laboratoires dans le monde
et surtout dans les pays à ressources limitées où des fonds
alloués n’étaient pas à la hauteur de la menace [1,2]. Les
tests Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction
(RT-PCR) reconnus comme technique de référence de
diagnostic d’infection par le SARS-CoV-2 ont été
difficiles d’accès dans de nombreux pays durant les deux
premières vagues [3-6]. D’où l’intérêt des paramètres de
suivi biologique des patients infectés par le SARS-CoV-2
et présentant des signes cliniques sévères en milieu
hospitalier [7]. Des résultats PCR pouvaient manquer ou
s’avérer négatifs, des paramètres vitaux devraient être
scrutés à la recherche des complications, surtout chez des
patients présentant des comorbidités [8,9]. La République
Centrafricaine qui a diagnostiqué son premier cas de
Covid-19 le 14 mars 2020 avait entretemps traversé deux
vagues successives dont la plus meurtrière entre février et
avril 2021, juste avant le lancement officiel de la
campagne nationale de vaccination anti-Covid-19 [10].
Du début de la pandémie jusqu’à l’introduction du vaccin,
l’espoir reposait sur les thérapeutiques proposées par les
sociétés savantes ou des comités techniques. Toutefois,
l’efficacité initialement reconnue de certaines molécules
ne faisaient pas toujours l’unanimité dans la communauté
scientifique. La corticothérapie et l’oxygénothérapie
étaient les traitements les plus utilisés dans la mesure où
les dispositifs de réanimations et les paramètres de suivis
biologiques pouvaient être minutieusement assurés. Mais
au fil du temps, des traitements efficaces ont été trouvés,
dont les antiviraux et les anticorps monoclonaux [11-13].
C’est dans ce contexte de connaissance approximative de
traitement de Covid-19 et d’absence de vaccination que le
Laboratoire National de Biologie Clinique et de Santé
Publique s’était engagé à assurer le suivi biologique
(paramètres d’analyses chimiques, hématologiques et
immunologiques) des patients hospitalisés au Centre de
Prise en Charge des personnes infectées.
Le but de cette étude était de rechercher l’impact de
l’infection par le SARS-CoV-2 sur les variations des
paramètres de suivi biologique des patients atteints de
Covid-19 et hospitalisés dans un état grave en l’absence
de traitement et de vaccination.
PATIENTS ET METHODES
L’étude s’était déroulée au Laboratoire National de
Biologie Clinique et de Santé Publique. Le principal
centre de prise en charge de Covid-19 était le Centre
National Hospitalier Universitaire de Bangui qui disposait
de 114 lits dont 16 de la réanimation étaient réservés à la
prise en charge contre la pandémie de Covid-19. Il
s’agissait d’une étude transversale de 3 mois couvrant la
période du 1er mai au 31 juillet 2020. La population
d’étude était constituée des patients disposant des données
de laboratoires, hospitalisés pour Covid-19 sévère avec ou
sans tests RT-PCR SARS-CoV-2 positifs. Les patients
non consentants et ceux qui ne disposaient pas de données
suffisantes d’analyses biologiques et virologiques
n’avaient pas été retenus. Des fiches de collectes de
données établies pour la circonstance ont permis de
recueillir les paramètres sociodémographiques, cliniques,
biologiques et virologiques des patients. Ces données ont
ensuite été saisies puis analysées à l’aide du logiciel Epi-
info version 7.2.3.0. Afin de rechercher la plausibilité de
l’association entre les variations de paramètres
biologiques et la positivité des tests RT-PCR, le test de
Khi2 de Pearson et le test exact de fisher ont été utilisés
pour les variables catégorielles, avec un intervalle de
confiance de 95%. Les différences étaient jugées
statistiquement significatives pour une valeur de p
inférieure à 0,05. Les échantillons accompagnés de la
fiche de collecte de données et de bulletins de demande
d’examens étaient analysés au LNBCSP conformément au
Guide de Bonne Exécution d’Analyses biologiques en
vigueur. Ainsi, les analyses hématologiques étaient
effectuées sur l’analyseur SYSMEX® XN330 (Sysmex
Europe GmbH Bonnbarch, 22848 Norderstedt, Germany),
les paramètres biochimiques sur l’automate Cobas c311
(Roche Diagnostics GmbH, Sandhofer Str.116
Mannheim, Germany) et les analyses immuno-
sérologiques sur l’automate Cobas e411 (Roche
Diagnostics GmbH, Sandhofer Str.116 Mannheim,
Germany). Les paramètres des patients recueillis étaient
comparés aux valeurs normales qui étaient les suivantes
pour les paramètres biologiques sélectionnés ci-dessous :
Antigène spécifique de la prostate (PSA) : <4 ng/ml
Aspartates aminotranspeptidases (ASAT) : 4 à 38 UI/L
Alanines aminotransferases (ALAT) : 4 à 40 UI/L
Créatininémie : 6 à 14 mg/L
Glycémie à jeun : 0,60 à 1,10 g/L
Hémoglobine : 12 à 14 g/dL
Numération des lymphocytes CD4 : 500 à 1000
éléments/mm3
Numération des leucocytes : 4 000 à 10 000
éléments/mm3
Numération des plaquettes : ≥ 150.000 éléments/mm3
Urée sanguine : 0,15 à 0,45 g/L
Les résultats communiqués en temps réels aux cliniciens
par téléphone ou par courriel contribuaient au suivi
clinique et biologique des patients.
Les analyses qualitatives ont été la sérologie Covid-19
IgM/IgG (kit IgM/IgG DUO® de TURKLABTIBBI
MALZEMELER SAN, Obs/Menderes/Izmir, Turquie) et
la sérologie VIH (Elecsys VIH Cobas e411 de Roche
Diagnostics GmbH, Sandhofer Str.116 Mannheim,
Germany). L'extraction de l'ARN du SARS-COV-2 a été
réalisée sur des prélèvements oropharyngés et
nasopharyngés. L'inactivation du virus a été effectuée
sous un poste de biosécurité de type 2 à l'aide d'un tampon
de lyse, suivie d'une extraction d'ARN viral à l'aide des
kits DAAN GENE (Co., Ltd. Of Sun Yat-sen University
référence : Numéro de Lot : 56602634/Date de révision :
05-05-2020/Date de Péremption : 07-2021/N°.19,
Xiangshan Road, Science Park, High and New
Technology Development District, Guangzhou,
Guangdong, P. R. China) et Qiagen (KIT d’Extraction
QIAGEN GmbH, QIAGEN Strasse 1,40724 Hilden,
GERMANY Référence : 52906 / Numéro de Lot :
566044/ Date de révision : 05-05-2020/ Date de
Péremption : 22-08-2021), conformément aux procédures